また、モバイルICOCAは「EX予約専用ICカード」との併用ができません。

新幹線に乗車する駅の在来線改札口から入場する場合、新幹線乗換改札機にEX-ICカードと交通系ICカード（SMART ICOCAなど）を2枚重ねてタッチして入場します。

新幹線乗換改札口から在来線改札口に出場する場合も、新幹線乗換改札機にEX-ICカードとSMART ICOCAなどを2枚重ねてタッチして出場します。

ただしこれができる交通系ICは物理カードのみで、モバイルICOCAなど携帯情報端末を新幹線改札機に重ねて利用することはできません。

モバイルICOCAとEX-ICを併用したければ、「EX予約」のサイトかアプリから、モバイルICOCAなどの情報を登録すると、EX-ICがなくてもスマホ1台で利用できます。

ただし、出張の都度会社からEX-ICカードを貸与されている人などは、この方法を利用できません。